1989年12月7日，AC米兰在欧洲超级杯决赛中对阵巴塞罗那，马尔蒂尼踢满全场，并帮助AC米兰在第二回合决赛中1:0战胜巴塞罗那球队夺得冠军。12月17日，马尔蒂尼又帮助球队击败了哥伦比亚球队麦德林民族足球俱乐部，夺得丰田杯冠军。1990年5月23日，马尔蒂尼帮助AC米兰在欧冠决赛中战胜本菲卡，连续二年夺得欧洲冠军俱乐部杯冠军。1989-90赛季，马尔蒂尼代表AC米兰参加意甲联赛、欧洲冠军俱乐部杯、欧洲超级杯和洲际杯等多项赛事，共出场47次。

1990年10月10日，AC米兰与桑普多利亚会师欧洲超级杯决赛，第一回合以1:1比分战平。决赛第二回合于11月29日进行，马尔蒂尼帮助球队以比分2:0战胜对手，蝉联欧洲超级杯冠军。12月9日，马尔蒂尼在AC米兰对阵巴拉圭奥林匹亚的洲际杯比赛中仅上场25分钟就因伤下场，最终AC米兰以3:0战胜巴拉圭奥林匹亚，蝉联丰田杯冠军。1990-91赛季，马尔蒂尼代表AC米兰参加意甲联赛、欧洲超级杯和洲际杯等多项赛事，共出场35次，打进4球。

在1991-92赛季的整个意甲联赛中，马尔蒂尼帮助AC米兰以不败的战绩夺得意甲联赛冠军。自意大利正式成立全国性的联赛以来，AC米兰是第一支在整个赛季中都保持不败的冠军球队。1991-92赛季，马尔蒂尼代表AC米兰在意甲联赛中出场31次，打进3球。在意大利杯比赛中马尔蒂尼出场7次，打进1球。

1992年8月30日，马尔蒂尼帮助AC米兰在意大利超级杯比赛中以2:1战胜AC帕尔马，夺得冠军。10月21日，AC米兰在欧冠联赛第2轮第一回合小组赛中，马尔蒂尼在第61分钟打进自己在欧冠联赛的第一个球，也是全场唯一进球，并帮助球队最终以5:0战胜布拉迪斯拉发足球俱乐部。1993年5月26日，马尔蒂尼代表AC米兰闯进欧冠决赛，但最终以0:1负于马赛，没能夺得冠军。1992-93赛季，马尔蒂尼代表AC米兰在联赛中出场31次，打进2球，帮助球队蝉联意甲联赛冠军。

在1993-94赛季的意甲联赛中，马尔蒂尼打进1球，并帮助球队连续三年夺得意甲冠军。1993年8月21日，马尔蒂尼帮助AC米兰击败都灵，蝉联意大利超级杯冠军。1994年3月2日，AC米兰在欧冠小组赛中2:1战胜云达不莱梅，马尔蒂尼在第48分钟成功打进1球。5月18日，AC米兰在欧冠决赛中对阵巴塞罗那，主教练法比奥·卡佩罗将马尔蒂尼安排在中后卫的位置，最终马尔蒂尼和队友们帮助AC米兰以4:0击败对手夺得冠军。1993-94赛季，马尔蒂尼代表AC米兰在联赛中出场30次，打进1球，帮助球队连续第三年夺得意甲冠军。1994年，马尔蒂尼被英国杂志《世界足球》评为“世界足球先生”，也是第1位获得该奖项的后卫球员。

1995年2月，马尔蒂尼帮助AC米兰在欧洲超级杯决赛中战胜阿森纳夺得冠军。5月24日，马尔蒂尼随球队再次挺进欧冠决赛，但最终AC米兰以0:1不敌阿贾克斯，与冠军失之交臂。1994-95赛季，马尔蒂尼代表AC米兰出场43次，打进2球。1995年，马尔蒂尼在“国际足联世界足球先生”的评选中获得第2名。

1996年4月28日，马尔蒂尼在意甲联赛中协助AC米兰3:1战胜佛罗伦萨，提前两轮夺得联赛冠军。1995-96赛季，马尔蒂尼代表AC米兰出场意甲联赛、欧洲联盟杯和意大利杯等赛事，共出场41次，打进3球。

临危受命

1996-97赛季，马尔蒂尼代表AC米兰在意甲联赛、欧洲冠军联赛和意大利杯等赛事中共出场36次，打进1球。该赛季AC米兰排名下滑，在意甲联赛中仅排名第11名。

1997-98赛季，马尔蒂尼在弗朗哥·巴雷西退役后成为米兰队长，代表AC米兰在各项赛事中出战了37场比赛。

1999年5月23日，AC米兰在联赛最后一轮以2:1战胜佩鲁贾，成功夺得联赛冠军，为在低谷中迎来百年庆典的AC米兰献上了一份大礼。1998-99赛季，马尔蒂尼代表AC米兰在意甲联赛中出场31次，在意大利杯中出场2次。

1999-01赛季，马尔蒂尼共代表AC米兰在各项赛事中一共出场87次，打进2球。

2001-02赛季，马尔蒂尼因膝部受伤错过AC米兰的大部分比赛，仅代表俱乐部出场19次。

米兰中兴

2003年5月28日，AC米兰在欧冠决赛中，马尔蒂尼与队友一同在点球大战中战胜尤文图斯，并作为队长亲自捧起个人第4座欧洲冠军联赛的奖杯。5月31日，马尔蒂尼帮助AC米兰以两回合6:3的总比分战胜罗马，夺得生涯唯一一次意大利杯冠军。2002-03赛季，马尔蒂尼代表AC米兰参加意甲联赛、欧洲冠军联赛和意大利杯等赛事，一共出场49次，打进2球。

2003年8月29日，在欧洲超级杯中，马尔蒂尼代表AC米兰对阵波尔图，以1:0战胜对手，夺得欧洲超级杯冠军。11月1日，在AC米兰1:1战平尤文图斯的意甲第八轮联赛中，马尔蒂尼第719次代表AC米兰出战。整个2003-04赛季，马尔蒂尼代表AC米兰在意甲联赛中出场30次，并再一次为AC米兰夺得联赛冠军，同时也是自己生涯第7次意甲联赛冠军。同年，马尔蒂尼在“欧洲金球奖”的评选中获得第3名。

2005年5月29日，AC米兰在欧冠决赛中对阵利物浦，马尔蒂尼在比赛开场仅52秒打进1球，创造了该赛季欧冠决赛最快进球纪录。但AC米兰最终在上半场3:0领先的大好局面下被利物浦在下半场扳平比分，并在点球大战中落败。2004-05赛季，马尔蒂尼共为球队出场47次，打进1球，帮助球队夺得了意大利超级杯冠军。

2005年9月18日，AC米兰对阵桑普多利亚的比赛中，马尔蒂尼代表AC米兰第800次出战正式联赛，追平佐夫保持的570场意甲出场记录。10月2日，马尔蒂尼在AC米兰对阵雷吉纳的比赛中打进整个联赛个人的两个进球。12月，马尔蒂尼膝盖受伤，致使在赛季剩余的比赛中仅出场过3次。2005-06赛季，马尔蒂尼共为AC米兰出场23次。

2007年5月23日，AC米兰在欧冠决赛中2:1战胜利物浦，夺得欧冠冠军，同时马尔蒂尼也追平弗朗西斯科·亨托创造的8次参加欧冠决赛的纪录。2006-07赛季，马尔蒂尼代表AC米兰在意甲联赛中仅出场18次，下半赛季由于伤病原因缺席大部分赛事。

2007年8月31日，AC米兰在欧洲超级杯决赛中3:1战胜塞维利亚，该战马尔蒂尼因伤缺席。12月16日，马尔蒂尼帮助AC米兰4:2战胜博卡青年，夺得世俱杯冠军。2008年2月16日，AC米兰在意甲第23轮比赛中对阵帕尔玛，马尔蒂尼在第70分钟出场，完成职业生涯的第1000场比赛。2008年3月30日，马尔蒂尼在本次意甲联赛中，代表AC米兰对阵亚特兰大，打进了职业生涯的最后一个进球。2007-08赛季，马尔蒂尼出场23次，打进1球。

主场告别

2008年4月，饱受伤病困扰的马尔蒂尼一度考虑结束自己的职业生涯，但两个月后，马尔蒂尼在膝伤有所好转的情况下和俱乐部完成了一年续约。

2009年2月18日，马尔蒂尼宣布在赛季结束后正式退役。2009年5月25日，马尔蒂尼最后一次在AC米兰主场以队长的名义出场，最终以比分2比3负于罗马，效力AC米兰24个赛季的马尔蒂尼告别圣西罗。2008-09赛季，马尔蒂尼出场32次，助攻1次。2009年7月1日，马尔蒂尼正式退役。

1988年3月31日，马尔蒂尼在国际足球友谊赛中首次代表国家队出场比赛，意大利队在客场1:1战平前南斯拉夫队。6月，马尔蒂尼以主力后卫的身份帮助意大利国家队杀进欧洲杯半决赛，并入选欧洲杯最佳阵容（后卫）。

1990年6月，马尔蒂尼随意大利国家队出征1990年意大利世界杯。6月9日，在小组赛首场意大利对阵奥地利的比赛中，马尔蒂尼迎来了世界杯首秀。7月3日，意大利国家队在半决赛中遭遇阿根廷队，在点球大战中以4:5输掉比赛。4天后，马尔蒂尼帮助意大利国家队2:1战胜英格兰夺得了世界杯季军。

1993年1月20日，在意大利队对阵墨西哥队的友谊赛中，马尔蒂尼在第80分钟打进个人在国家队的首个进球，帮助国家队以2:0战胜对手。

1994年6月，马尔蒂尼随意大利国家队出征1994年美国世界杯，帮助意大利队一路杀进决赛。但遗憾的是，意大利队又一次倒在了点球大战上，没能夺得冠军。同年，马尔蒂尼入选世界杯最佳阵容（后卫），1996年6月，马尔蒂尼随意大利国家队出征1996年英格兰欧洲杯，止步于小组赛第三名。同年，马尔蒂尼入选欧洲杯最佳阵容。

1998年6月，马尔蒂尼随意大利国家队在1998年法国世界杯中出场5次并踢满全场，在四分之一决赛中，意大利遭遇法国队，又一次倒在点球大战。

2000年6月，主教练佐夫在欧洲杯期间将马尔蒂尼的场上位置换到中后卫。6月29日，在半决赛中，意大利开局不久就被罚下一人，马尔蒂尼与队友顶住了荷兰队的多轮进攻，最终在点球大战中击败对手，历经4次点球大战，终于摆脱失败的厄运。7月2日，意大利队在欧洲杯决赛中对阵法国队，在第55分钟，意大利先发制人，在1-0领先法国的情况下，马尔蒂尼帮助团队保持领先优势接近最后一刻，却在补时阶段被维尔托德追平，加时第103分钟又被特雷泽盖打入制胜金球，最终以1:2负于法国队。10月7日，意大利在世预赛中对阵罗马利亚，马尔蒂尼完成了自己代表意大利国家队的第113场出场，超越佐夫成为当时意大利国家队出场次数最多的球员。

2002年6月，马尔蒂尼随意大利国家队出征2002年韩日世界杯。6月18日，意大利队在八分之一决赛中被韩国队爆冷淘汰出局。7月20日，马尔蒂尼宣布退出意大利国家队。

2018年8月，马尔蒂尼出任AC米兰足球俱乐部体育战略发展总监。2021年12月，马尔蒂尼荣获2021年度最佳经理人奖。

2021-2022赛季，马尔蒂尼引进门将迈尼昂、中锋吉鲁、中场托纳利、中场迪亚斯、中卫托莫里等名将，帮助球队时隔11年再次夺得意甲冠军。

2022年7月2日，马尔蒂尼与AC米兰续约两年，继续担任米兰技术总监。10月，马尔蒂尼被《都灵体育报》评为欧洲足坛年度最佳经理。11月，马尔蒂尼当选环球足球奖2022年最佳体育总监。

2023年，AC米兰俱乐部官方宣布，从6月5日开始，马尔蒂尼不再担任俱乐部技术总监。

保罗·马尔蒂尼在家中还有五个兄弟姐妹。马尔蒂尼的父亲塞萨尔·马尔蒂尼是前AC米兰传奇后卫，退役后退役后的老马尔蒂尼拿起教鞭，以助教的身份重回圣西罗。2016年4月3日，塞萨尔·马尔蒂尼因病去世，享年84岁。7月29日，马尔蒂尼的母亲玛丽萨·马祖凯利（Marisa Mazzucchelli）在丈夫去世四个月后也相继离世。

马尔蒂尼的妻子阿德里亚娜是一名模特，出生于委内瑞拉。1994年12月14日，26岁的马尔蒂尼与阿德里亚娜修成正果步入了婚姻的殿堂。婚后，阿德里亚娜为马尔蒂尼生下了两个儿子，大儿子叫克里斯蒂安·马尔蒂尼，二儿子叫丹尼尔·马尔蒂尼。两兄弟后来都加入了AC米兰青训营。

感染新冠

2020年3月21日，意大利AC米兰足球俱乐部在官网发布公告称保罗·马尔蒂尼于20日接受新冠病毒核酸试剂检测的结果呈阳性。

清理结石

2020年6月，保罗·马尔蒂尼接受手术治疗以清理肾结石，因而缺席米兰队内的会议，也未现身球队训练场。

2014年3月5日，马尔蒂尼参加罗纳尔多和齐达内朋友队举行的一场慈善赛，对手是瑞士的年轻人队。

2003年，马尔蒂尼和前国家队队友克里斯蒂安·维埃里联手投资创建了甜蜜年代Sweet Years（甜蜜年代）品牌，经过5年的发展后，Sweet Years成为了意大利一线的时尚服装品牌。2014年5月，马尔蒂尼和维埃里来到了中国广州为Sweet Years宣传造势。

2015年5月，马尔蒂尼联手体育传媒大亨里卡多·席尔瓦（Riccardo Silva）成功收购了北美足球联盟的迈阿密足球俱乐部，马尔蒂尼成为了该俱乐部的老板之一。

马尔蒂尼不仅稳健，而且左右脚能力非常均衡。马尔蒂尼也曾坦言自己在青年队花费了巨大的心血练习左脚，扎实的训练与勤奋不懈造就了属于AC米兰的左边位传奇。除了边位防守，高大强壮的身材与敏锐的洞察力使得他同样能胜任中后卫。他的防守能给出精妙的预判，先人一步从容化解对手的进攻，准确的卡位拦截又不伤害对手。（中国财政经济出版社 评）

马尔蒂尼赢得了一切，他是个榜样。很难找到代替马尔蒂尼的人，因为他是那样伟大。很幸运我曾经和他一起踢过球，我知道他有多么重要。我想说，他其实还可以踢下去，因为他的身体仍然非常好，一年下来没有什么问题。不过经过这么多年，我们可以坦然接受他退役的决定了。（巴雷西 评）

很遗憾我和马尔蒂尼没有机会在同一个俱乐部效力，他是一位谦谦君子，忠诚是他整个职业生涯的注脚，他挂靴离开绿茵场的时候，将是整个世界球迷最为悲痛的一天，因为我们失去了一段传奇。（劳尔 评）

AC米兰伟大的历史就是这支球队的精华所在，还有谁能比马尔蒂尼更能成为球队的代表人物呢？在40岁的年龄，他仍能保持在现在的状态，这就是米兰队的特点。（贝克汉姆 评）

保罗·马尔蒂尼是一位能将天才少年、老当益壮、忠心不二、精神领袖、英俊美男这几个词集于一身的球员。（新浪体育 评）

马尔蒂尼不抽烟、不喝酒，并忠于家庭。生活中的马尔蒂尼一如他球场上的作风，优雅而绅士，并且从来没有绯闻。（新晚报 评）

马尔蒂尼退役后，AC米兰将他的3号球衣封存，在米兰仅有巴雷西和马尔蒂尼一样享受此待遇。但和巴雷西不同的是，红黑3号还可能再次出现在球场上，两个儿子克里斯蒂安和丹尼尔都在AC米兰青年队踢球。